总工程师办公室主要职能是负责对财政性资金和国有企业资金投资项目进行监管、审查。具体如下：
一、对项目建设规模、规划设计方案、设计文件、实施方案等提供参考意见，审查工程施工过程中的设计更改；
二、审查项目工程咨询（代理）、勘察、设计、监理、施工招标文件以及与工程有关的重要设备采购发包方案；
三、配合相关职能部门对建设程序合理合法性进行监督，审查与工程相关的合同；
四、审核开发区公建项目的工程进度款；
五、抽查工程质量、安全和进度；
六、参与工程主材、设备的采购和询价；
七、参与工程验收；
八、负责办理工程概算、预算和结算工作；
九、参加对重大工程技术问题专家咨询工作；
十、协助公共建设项目工程建设管理制度相关规范性文件的起草工作；
十一、负责向管委会报告工程建设情况，并对需要协调和解决的问题提出供领导决策参考的意见和建议；
十二、负责开发区领导交办的其他工作。
